MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Escherichia coli W plasmid pRK1

Total Repeats: 2073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017637	GCG	2	6	35	40	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017637	CCGGC	2	10	44	53	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_017637	GGC	2	6	168	173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017637	GTC	2	6	179	184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017637	GCT	2	6	205	210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017637	CCG	2	6	228	233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_017637	CGC	2	6	310	315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017637	GT	3	6	356	361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017637	GCA	2	6	383	388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017637	GCC	2	6	401	406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017637	G	6	6	441	446	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017637	AGG	2	6	626	631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017637	CTC	2	6	640	645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017637	TCAG	2	8	698	705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017637	CAA	2	6	732	737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386611789
16	NC_017637	TCG	2	6	746	751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611789
17	NC_017637	GTG	2	6	886	891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611789
18	NC_017637	CAC	2	6	1058	1063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611789
19	NC_017637	CAG	2	6	1093	1098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611789
20	NC_017637	CGA	2	6	1124	1129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611789
21	NC_017637	A	6	6	1129	1134	100 %	0 %	0 %	0 %	386611789
22	NC_017637	AGCCTC	2	12	1181	1192	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	386611789
23	NC_017637	AAC	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386611789
24	NC_017637	CCT	2	6	1207	1212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386611789
25	NC_017637	CGA	2	6	1221	1226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611789
26	NC_017637	TG	3	6	1272	1277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017637	GAT	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611790
28	NC_017637	GTT	2	6	1368	1373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611790
29	NC_017637	GAT	2	6	1401	1406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611790
30	NC_017637	GTAA	2	8	1525	1532	50 %	25 %	25 %	0 %	386611790
31	NC_017637	AAT	2	6	1587	1592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017637	AGT	2	6	1599	1604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611791
33	NC_017637	ACC	2	6	1621	1626	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611791
34	NC_017637	AAGC	2	8	1631	1638	50 %	0 %	25 %	25 %	386611791
35	NC_017637	CTG	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
36	NC_017637	GGA	2	6	1692	1697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611791
37	NC_017637	CAC	2	6	1730	1735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611791
38	NC_017637	CTG	2	6	1807	1812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
39	NC_017637	CCTG	2	8	1833	1840	0 %	25 %	25 %	50 %	386611791
40	NC_017637	CGC	2	6	1857	1862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611791
41	NC_017637	GGT	2	6	1864	1869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611791
42	NC_017637	GCA	2	6	1879	1884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611791
43	NC_017637	CAT	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611791
44	NC_017637	ATT	2	6	1942	1947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386611791
45	NC_017637	TCG	2	6	1992	1997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
46	NC_017637	CTG	2	6	2077	2082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
47	NC_017637	AGA	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611791
48	NC_017637	CAC	2	6	2169	2174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611791
49	NC_017637	GGCGCT	2	12	2187	2198	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386611791
50	NC_017637	CG	3	6	2211	2216	0 %	0 %	50 %	50 %	386611791
51	NC_017637	CAGGTG	2	12	2218	2229	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	386611791
52	NC_017637	GCC	2	6	2236	2241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611791
53	NC_017637	GGT	2	6	2257	2262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611791
54	NC_017637	GTGGCG	2	12	2308	2319	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	386611791
55	NC_017637	GCC	2	6	2431	2436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611791
56	NC_017637	CTG	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
57	NC_017637	GCCGGA	2	12	2559	2570	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	386611791
58	NC_017637	GAAC	2	8	2604	2611	50 %	0 %	25 %	25 %	386611791
59	NC_017637	TGA	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611791
60	NC_017637	ACG	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611791
61	NC_017637	CTG	2	6	2659	2664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
62	NC_017637	GTG	3	9	2740	2748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611791
63	NC_017637	TG	4	8	2766	2773	0 %	50 %	50 %	0 %	386611791
64	NC_017637	GTG	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611791
65	NC_017637	GAC	2	6	2815	2820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611791
66	NC_017637	GGA	2	6	2859	2864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611791
67	NC_017637	CTG	2	6	2878	2883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
68	NC_017637	ACGC	2	8	2901	2908	25 %	0 %	25 %	50 %	386611791
69	NC_017637	GCA	2	6	2920	2925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611791
70	NC_017637	GCA	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611791
71	NC_017637	CTG	2	6	2956	2961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
72	NC_017637	ATT	2	6	3038	3043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386611791
73	NC_017637	GAAG	2	8	3069	3076	50 %	0 %	50 %	0 %	386611791
74	NC_017637	CTG	2	6	3124	3129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611791
75	NC_017637	GAC	2	6	3153	3158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611791
76	NC_017637	TCAG	2	8	3170	3177	25 %	25 %	25 %	25 %	386611791
77	NC_017637	TGG	2	6	3310	3315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611791
78	NC_017637	CTT	2	6	3333	3338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386611791
79	NC_017637	GAA	2	6	3420	3425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611791
80	NC_017637	TG	3	6	3488	3493	0 %	50 %	50 %	0 %	386611791
81	NC_017637	CAC	2	6	3494	3499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611791
82	NC_017637	CAGA	2	8	3505	3512	50 %	0 %	25 %	25 %	386611791
83	NC_017637	GCC	2	6	3544	3549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611791
84	NC_017637	TGA	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611791
85	NC_017637	CCGCC	2	10	3565	3574	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
86	NC_017637	GCA	2	6	3587	3592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017637	TGA	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611792
88	NC_017637	ACTGA	2	10	3613	3622	40 %	20 %	20 %	20 %	386611792
89	NC_017637	TGC	2	6	3672	3677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611792
90	NC_017637	TCAC	2	8	3701	3708	25 %	25 %	0 %	50 %	386611792
91	NC_017637	GAT	2	6	3744	3749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611792
92	NC_017637	TC	3	6	3854	3859	0 %	50 %	0 %	50 %	386611792
93	NC_017637	TGG	2	6	3888	3893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611792
94	NC_017637	CGT	2	6	3906	3911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611792
95	NC_017637	CAT	2	6	4002	4007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611792
96	NC_017637	AGG	2	6	4026	4031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611792
97	NC_017637	GCC	2	6	4086	4091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611793
98	NC_017637	GGCTGT	2	12	4097	4108	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	386611793
99	NC_017637	AAC	2	6	4114	4119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386611793
100	NC_017637	GTC	3	9	4120	4128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611793
101	NC_017637	CTTT	2	8	4165	4172	0 %	75 %	0 %	25 %	386611793
102	NC_017637	T	6	6	4218	4223	0 %	100 %	0 %	0 %	386611793
103	NC_017637	AGG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611793
104	NC_017637	TGGC	2	8	4269	4276	0 %	25 %	50 %	25 %	386611793
105	NC_017637	TTC	2	6	4318	4323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386611793
106	NC_017637	CCGT	2	8	4356	4363	0 %	25 %	25 %	50 %	386611793
107	NC_017637	GCG	2	6	4382	4387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386611793
108	NC_017637	GCC	2	6	4423	4428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611793
109	NC_017637	ACG	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386611793
110	NC_017637	CTGGT	2	10	4541	4550	0 %	40 %	40 %	20 %	386611793
111	NC_017637	GTT	2	6	4551	4556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611793
112	NC_017637	GAG	2	6	4557	4562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611793
113	NC_017637	GTG	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611793
114	NC_017637	TCA	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611793
115	NC_017637	AGG	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611793
116	NC_017637	GGC	2	6	4654	4659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386611793
117	NC_017637	GTG	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611793
118	NC_017637	GAT	2	6	4724	4729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611793
119	NC_017637	ATG	2	6	4754	4759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611793
120	NC_017637	GGT	2	6	4826	4831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611794
121	NC_017637	GGA	2	6	4840	4845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386611794
122	NC_017637	CTG	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611794
123	NC_017637	ACC	2	6	4865	4870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611794
124	NC_017637	CTG	2	6	4928	4933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611794
125	NC_017637	GAA	2	6	4991	4996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386611794
126	NC_017637	GCC	2	6	5117	5122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611794
127	NC_017637	CCG	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386611794
128	NC_017637	CAT	2	6	5247	5252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386611794
129	NC_017637	GTG	2	6	5282	5287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611794
130	NC_017637	GGT	2	6	5407	5412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017637	GCG	2	6	5424	5429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017637	CGG	2	6	5463	5468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017637	CGT	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017637	CGC	2	6	5595	5600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017637	CCT	2	6	5616	5621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017637	GGCAC	2	10	5762	5771	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017637	GGA	2	6	5800	5805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017637	TGT	2	6	5818	5823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386611795
139	NC_017637	CTG	2	6	5829	5834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611795
140	NC_017637	TGACC	2	10	5890	5899	20 %	20 %	20 %	40 %	386611795
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147	NC_017637	CGG	2	6	6329	6334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017637	GCC	2	6	6351	6356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017637	GCCT	2	8	6378	6385	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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152	NC_017637	TGT	2	6	6465	6470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017637	GGC	2	6	6514	6519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017637	GTC	2	6	6525	6530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017637	GCT	2	6	6551	6556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_017637	CCG	2	6	6743	6748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_017637	CAG	2	6	6812	6817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_017637	A	6	6	6866	6871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017637	GTG	2	6	6906	6911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017637	GAA	2	6	6954	6959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017637	CCTCT	2	10	7583	7592	0 %	40 %	0 %	60 %	386611796
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237	NC_017637	TTTAT	2	10	10773	10782	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
238	NC_017637	ATAA	2	8	10807	10814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_017637	A	6	6	10819	10824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
240	NC_017637	GAA	2	6	10827	10832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
241	NC_017637	T	7	7	10840	10846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_017637	GTG	2	6	10892	10897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
243	NC_017637	ACC	2	6	10906	10911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
244	NC_017637	TTG	2	6	10920	10925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
245	NC_017637	CGT	2	6	10929	10934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_017637	TTC	2	6	10937	10942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
247	NC_017637	GCG	2	6	10956	10961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
248	NC_017637	GT	3	6	10980	10985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
249	NC_017637	GCC	2	6	11028	11033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
250	NC_017637	G	6	6	11068	11073	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
251	NC_017637	TACA	2	8	11074	11081	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
252	NC_017637	GTC	2	6	11100	11105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_017637	GA	3	6	11111	11116	50 %	0 %	50 %	0 %	386611803
254	NC_017637	GTG	2	6	11191	11196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386611803
255	NC_017637	CTC	2	6	11265	11270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386611803
256	NC_017637	GAG	2	6	11308	11313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017637	TGA	2	6	11320	11325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611804
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266	NC_017637	TGA	2	6	11677	11682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386611804
267	NC_017637	CCA	2	6	11729	11734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386611804
268	NC_017637	TGAT	2	8	11773	11780	25 %	50 %	25 %	0 %	386611804
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270	NC_017637	GTC	2	6	11824	11829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386611804
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